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    CRISPR Cas9基因編輯細胞系

      發布時間: 2022-06-11      瀏覽量:305

              CRISPR/Cas(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats and CRISPR associated)系統是細菌在噬菌體長期選擇壓力下,進化出的一種有效的獲得性免疫機制。CRISPR簇廣泛存在于細菌和古細菌的基因組中,是一個特殊的DNA重復序列家族。其由一個前導區(leader)、多個重復序列區(repeat)和多個間隔區(spacer)構成。前導區被認為可能是CRISPR簇的啟動子,重復序列區可形成發卡結構,間隔區由俘獲的外源DNA組成。CRISPR簇附近存在一個多態性家族基因,編碼的蛋白質均具有核酸酶、解旋酶、整合酶和聚合酶等活性,并能與CRISPR區域發生相互作用,被命名為Cas(CRISPR associated)基因。當外源DNA入侵時,在前導區的調控下,CRISPR被轉錄為長的RNA前體(pre-CRISPR RNA, pre-crRNA),并通過加工成為一系列含有保守重復序列和間隔區的成熟crRNA,然后識別并結合到與其互補的外源DNA序列上發揮剪切作用。

    CRISPR-示意圖.jpg

    CRISPR/Cas9作用原理

             根據Cas蛋白質和參與序列的不同,將目前發現的CRISPR/Cas系統分為Ⅰ型、Ⅱ型和Ⅲ型。其中,Ⅰ型和Ⅲ型需要多種Cas蛋白共同發揮作用,而Ⅱ型由Cas9單獨參與,是研究較為深入的一種類型。在pre-crRNA轉錄的同時,與其重復序列互補的反式激活crRNA(trans-activating crRNA,tracrRNA)也轉錄出來。Cas9首先與crRNA和tracrRNA結合形成復合物,此復合物通過與PAM序列結合并侵入DNA,形成RNA-蛋白-DNA復合結構,進而在與crRNA配對的序列靶點剪切雙鏈DNA。通過人工設計這兩種RNA,可以改造形成具有引導作用的sgRNA(single guide RNA),通過將表達sgRNA的元件與表達Cas9的元件相連接,得到可以同時表達兩者的質粒,便能夠對目的基因進行操作,以引導Cas9對DNA的定點切割。


    CRISPR系統作用原理.jpg

                                                                                                                            CRISPR/Cas9系統的作用原理

    CRISPR/Cas9系統元件

            CRISPR/Cas9系統需要兩個關鍵基因序列:gRNA和Cas9,gRNA的功能是識別目的DNA序列,并引導Cas9蛋白到目的基因序列處進行切割。gRNA序列由兩部分組成:能夠與目的基因匹配的序列和能夠與Cas9蛋白結合的序列。Cas9是一種能切割DNA雙鏈的核酸內切酶,在匹配的基因的PAM序列的下游3-4堿基處進行DNA雙鏈的切割。


    成功基因編輯細胞類型精選


    分類細胞名稱縮寫
    血液和淋巴系統小鼠單核巨噬細胞白血病細胞RAW264.7
    人B淋巴母細胞HMy2.CIR
    人T淋巴細胞白血病細胞HuT78
    人單核細胞白血病THP-1
    人慢性髓系白血病細胞K-562
    人原髓細胞白血病細胞HL-60
    人白血病T淋巴細胞Jurkat,   Clone E6-1
    骨骼、皮膚系統小鼠黑色素瘤細胞B16
    小鼠皮膚黑色素瘤細胞B16-F10
    人骨肉瘤細胞U-2OS
    人惡性黑色素瘤細胞A375
    人纖維肉瘤細胞HT-1080
    消化系統小鼠結腸癌細胞CT26.WT
    人回盲腸癌細胞HCT-8
    人結腸癌細胞HCT116
    HT-29
    人結腸腺癌細胞SW480
    人結直腸癌細胞LoVo
    人食管鱗癌細胞KYSE-150
    人胃癌細胞HGC-27
    呼吸系統小鼠肺癌細胞LLC
    倉鼠肺細胞V79
    人正常肺上皮細胞BEAS-2B
    人大細胞肺癌細胞NCI-H460
    人非小細胞肺癌細胞NCI-H1299
    A549
    人肺鱗癌細胞SK-MES-1
    NCI-H520
    泌尿系統小鼠腎小球系膜細胞SV40 MES13
    大鼠腎上腺嗜鉻細胞瘤細胞PC-12
    大鼠腎細胞NRK
    非洲綠猴腎細胞Vero
    恒河猴腎細胞LLC-MK2
    人膀胱癌細胞5637
    人前列腺癌細胞PC-3
    人胚腎細胞293 Cells
    人腎細胞腺癌細胞786-O
    ACHN
    腦和神經系統小鼠垂體瘤細胞AtT-20
    大鼠膠質瘤細胞C6
    人膠質瘤細胞U251
    人神經母細胞瘤細胞SK-N-SH
    內分泌系統小鼠乳腺癌細胞4T1
    人乳腺癌細胞MCF-7
    MDA-MB-231
    生殖系統倉鼠卵巢細胞亞株CHO-K1
    人宮頸癌細胞Hela
    人卵巢癌細胞SK-OV-3
    循環系統小鼠成肌細胞C2C12
    大鼠成肌細胞L6
    大鼠心肌細胞H9c2(2-1)




    案例精選


                                                                                        人HEK293細胞NDFIP1基因敲除

                 通過CRISPR/Cas9基因編輯技術敲除HEK293細胞的NDFIP1基因。篩選后挑單克隆,并通過PCR及測序檢測以及Western Blot驗證,成功獲得NDFIP1基因敲除的純合細胞。細胞檢測結果:無菌、無支原體。培養體系:DMEM+ 10% FBS;1:3傳代。

    CRISPR篩選流程及數據展示 水印版.png


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